Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EgfrQ01279 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EgfrQ01279 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EgfrQ01279 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EgfrQ01279 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EgfrQ01279 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms