Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja5Q01231 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gja5Q01231 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gja5Q01231 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja5Q01231 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms