Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Il6stQ00560 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Il6stQ00560 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Il6stQ00560 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Il6stQ00560 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms