Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Nbr1P97432 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Nbr1P97432 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Nbr1P97432 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Nbr1P97432 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Nbr1P97432 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Nbr1P97432 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nbr1P97432 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nbr1P97432 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nbr1P97432 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Nbr1P97432 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,5 ms