Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1b3P97370 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atp1b3P97370 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp1b3P97370 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b3P97370 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms