Protein–RNA interactions for Protein: P84751

Ig heavy chain Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84751 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P84751 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P84751 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P84751 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P84751 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P84751 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P84751 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P84751 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P84751 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P84751 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P84751 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P84751 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P84751 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P84751 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P84751 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P84751 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P84751 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P84751 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P84751 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P84751 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P84751 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P84751 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P84751 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P84751 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P84751 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P84751 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P84751 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P84751 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P84751 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P84751 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P84751 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P84751 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P84751 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms