Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tp53bp1P70399 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tp53bp1P70399 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53bp1P70399 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53bp1P70399 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms