Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sycp3P70281 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp3P70281 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp3P70281 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp3P70281 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms