Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn1P70268 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkn1P70268 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn1P70268 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn1P70268 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms