Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2kP61087 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2kP61087 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms