Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia3P60469 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ppfia3P60469 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms