Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpaP58389 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpaP58389 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpaP58389 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpaP58389 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpaP58389 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpaP58389 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpaP58389 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtpaP58389 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtpaP58389 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpaP58389 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtpaP58389 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms