Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c38P56655 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c38P56655 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c38P56655 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c38P56655 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c38P56655 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp2c38P56655 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp2c38P56655 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp2c38P56655 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp2c38P56655 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c38P56655 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c38P56655 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c38P56655 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c38P56655 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c38P56655 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms