Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctbp2P56546 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ctbp2P56546 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctbp2P56546 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms