Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CartptP56388 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CartptP56388 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CartptP56388 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CartptP56388 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CartptP56388 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CartptP56388 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CartptP56388 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CartptP56388 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CartptP56388 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CartptP56388 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CartptP56388 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CartptP56388 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CartptP56388 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CartptP56388 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CartptP56388 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CartptP56388 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CartptP56388 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CartptP56388 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CartptP56388 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CartptP56388 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CartptP56388 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CartptP56388 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CartptP56388 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CartptP56388 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CartptP56388 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CartptP56388 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CartptP56388 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CartptP56388 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CartptP56388 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms