Protein–RNA interactions for Protein: P55850

Dsc3, Desmocollin-3, mousemouse

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc3P55850 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsc3P55850 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc3P55850 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsc3P55850 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms