Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtskP55097 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtskP55097 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtskP55097 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtskP55097 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtskP55097 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtskP55097 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtskP55097 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtskP55097 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtskP55097 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtskP55097 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtskP55097 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtskP55097 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtskP55097 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtskP55097 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtskP55097 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtskP55097 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtskP55097 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtskP55097 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtskP55097 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtskP55097 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtskP55097 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtskP55097 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtskP55097 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtskP55097 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtskP55097 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtskP55097 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtskP55097 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CtskP55097 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtskP55097 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtskP55097 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtskP55097 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtskP55097 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtskP55097 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtskP55097 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtskP55097 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtskP55097 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CtskP55097 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtskP55097 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtskP55097 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtskP55097 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtskP55097 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtskP55097 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtskP55097 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtskP55097 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtskP55097 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtskP55097 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CtskP55097 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtskP55097 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtskP55097 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtskP55097 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtskP55097 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtskP55097 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtskP55097 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtskP55097 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms