Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NcanP55066 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NcanP55066 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcanP55066 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcanP55066 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcanP55066 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcanP55066 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NcanP55066 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NcanP55066 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NcanP55066 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NcanP55066 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NcanP55066 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NcanP55066 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NcanP55066 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NcanP55066 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NcanP55066 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NcanP55066 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NcanP55066 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NcanP55066 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NcanP55066 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NcanP55066 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NcanP55066 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NcanP55066 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NcanP55066 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NcanP55066 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NcanP55066 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NcanP55066 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NcanP55066 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NcanP55066 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NcanP55066 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NcanP55066 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NcanP55066 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NcanP55066 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NcanP55066 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NcanP55066 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NcanP55066 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NcanP55066 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NcanP55066 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NcanP55066 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NcanP55066 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NcanP55066 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NcanP55066 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NcanP55066 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NcanP55066 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NcanP55066 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NcanP55066 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NcanP55066 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NcanP55066 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcanP55066 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcanP55066 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NcanP55066 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcanP55066 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NcanP55066 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcanP55066 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcanP55066 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcanP55066 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcanP55066 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NcanP55066 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NcanP55066 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NcanP55066 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NcanP55066 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NcanP55066 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NcanP55066 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NcanP55066 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NcanP55066 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcanP55066 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcanP55066 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcanP55066 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcanP55066 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NcanP55066 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NcanP55066 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NcanP55066 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NcanP55066 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NcanP55066 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NcanP55066 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NcanP55066 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NcanP55066 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NcanP55066 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NcanP55066 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NcanP55066 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NcanP55066 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NcanP55066 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NcanP55066 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NcanP55066 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NcanP55066 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NcanP55066 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NcanP55066 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms