Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc4P54775 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psmc4P54775 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc4P54775 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc4P54775 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmc4P54775 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc4P54775 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms