Protein–RNA interactions for Protein: P53783

Sox1, Transcription factor SOX-1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox1P53783 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox1P53783 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox1P53783 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox1P53783 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox1P53783 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox1P53783 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox1P53783 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox1P53783 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox1P53783 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox1P53783 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox1P53783 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox1P53783 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox1P53783 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms