Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lbx1P52955 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lbx1P52955 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lbx1P52955 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms