Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dbx1P52950 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dbx1P52950 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dbx1P52950 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dbx1P52950 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dbx1P52950 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms