Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs7P50715 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Defa-rs7P50715 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa-rs7P50715 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms