Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CratP47934 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CratP47934 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CratP47934 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CratP47934 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CratP47934 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CratP47934 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CratP47934 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CratP47934 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CratP47934 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CratP47934 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CratP47934 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CratP47934 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CratP47934 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CratP47934 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CratP47934 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CratP47934 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CratP47934 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CratP47934 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CratP47934 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CratP47934 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CratP47934 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CratP47934 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CratP47934 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CratP47934 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CratP47934 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CratP47934 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CratP47934 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CratP47934 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CratP47934 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CratP47934 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CratP47934 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CratP47934 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CratP47934 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CratP47934 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CratP47934 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CratP47934 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CratP47934 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CratP47934 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CratP47934 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CratP47934 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CratP47934 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CratP47934 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CratP47934 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CratP47934 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CratP47934 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CratP47934 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CratP47934 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CratP47934 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CratP47934 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CratP47934 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CratP47934 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CratP47934 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CratP47934 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CratP47934 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CratP47934 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CratP47934 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CratP47934 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CratP47934 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CratP47934 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CratP47934 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms