Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli1P47806 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli1P47806 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gli1P47806 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gli1P47806 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gli1P47806 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gli1P47806 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms