Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf4P47741 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf4P47741 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf4P47741 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf4P47741 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms