Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
InaP46660 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
InaP46660 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
InaP46660 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
InaP46660 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
InaP46660 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
InaP46660 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
InaP46660 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
InaP46660 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
InaP46660 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
InaP46660 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
InaP46660 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
InaP46660 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
InaP46660 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
InaP46660 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
InaP46660 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
InaP46660 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InaP46660 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InaP46660 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InaP46660 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
InaP46660 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InaP46660 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
InaP46660 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
InaP46660 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
InaP46660 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
InaP46660 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InaP46660 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
InaP46660 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
InaP46660 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
InaP46660 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InaP46660 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
InaP46660 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
InaP46660 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
InaP46660 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
InaP46660 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
InaP46660 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
InaP46660 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
InaP46660 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InaP46660 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
InaP46660 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InaP46660 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
InaP46660 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
InaP46660 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
InaP46660 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
InaP46660 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InaP46660 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
InaP46660 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InaP46660 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InaP46660 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InaP46660 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms