Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf9P41274 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf9P41274 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf9P41274 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms