Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cap1P40124 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cap1P40124 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cap1P40124 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cap1P40124 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cap1P40124 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cap1P40124 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cap1P40124 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cap1P40124 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cap1P40124 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cap1P40124 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 516.2 ms