Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik2P39087 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik2P39087 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik2P39087 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik2P39087 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik2P39087 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik2P39087 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik2P39087 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik2P39087 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik2P39087 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms