Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh4P39038 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh4P39038 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh4P39038 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh4P39038 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh4P39038 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh4P39038 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh4P39038 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh4P39038 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh4P39038 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh4P39038 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh4P39038 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh4P39038 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh4P39038 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh4P39038 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh4P39038 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh4P39038 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh4P39038 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh4P39038 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh4P39038 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh4P39038 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh4P39038 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh4P39038 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh4P39038 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdh4P39038 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh4P39038 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh4P39038 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh4P39038 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh4P39038 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms