Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc3P33622 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc3P33622 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms