Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckmt1P30275 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckmt1P30275 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckmt1P30275 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckmt1P30275 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms