Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn10P28658 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn10P28658 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn10P28658 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms