Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CenpbP27790 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CenpbP27790 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CenpbP27790 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CenpbP27790 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpbP27790 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CenpbP27790 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CenpbP27790 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms