Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afxP27661 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afxP27661 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afxP27661 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afxP27661 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2afxP27661 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afxP27661 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afxP27661 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afxP27661 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms