Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou2f1P25425 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pou2f1P25425 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms