Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf8P23611 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf8P23611 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf8P23611 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf8P23611 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf8P23611 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf8P23611 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf8P23611 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irf8P23611 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf8P23611 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf8P23611 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf8P23611 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf8P23611 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf8P23611 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf8P23611 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf8P23611 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf8P23611 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf8P23611 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf8P23611 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf8P23611 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf8P23611 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms