Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edn1P22387 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn1P22387 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Edn1P22387 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn1P22387 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms