Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnc1P19123 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnc1P19123 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms