Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ntrk2P15209 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ntrk2P15209 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ntrk2P15209 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ntrk2P15209 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ntrk2P15209 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Ntrk2P15209 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ntrk2P15209 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Ntrk2P15209 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ntrk2P15209 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ntrk2P15209 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ntrk2P15209 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ntrk2P15209 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ntrk2P15209 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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