Protein–RNA interactions for Protein: P13439

Umps, Uridine 5'-monophosphate synthase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmpsP13439 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UmpsP13439 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmpsP13439 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmpsP13439 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmpsP13439 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UmpsP13439 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UmpsP13439 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms