Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DmdP11531 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DmdP11531 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DmdP11531 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DmdP11531 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DmdP11531 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DmdP11531 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DmdP11531 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DmdP11531 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DmdP11531 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DmdP11531 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DmdP11531 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DmdP11531 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DmdP11531 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DmdP11531 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DmdP11531 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DmdP11531 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DmdP11531 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DmdP11531 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DmdP11531 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DmdP11531 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DmdP11531 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DmdP11531 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DmdP11531 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DmdP11531 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmdP11531 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmdP11531 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmdP11531 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DmdP11531 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmdP11531 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmdP11531 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmdP11531 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmdP11531 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmdP11531 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmdP11531 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DmdP11531 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DmdP11531 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DmdP11531 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmdP11531 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DmdP11531 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DmdP11531 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmdP11531 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmdP11531 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmdP11531 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmdP11531 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmdP11531 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmdP11531 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DmdP11531 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmdP11531 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DmdP11531 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmdP11531 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmdP11531 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmdP11531 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmdP11531 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmdP11531 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmdP11531 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmdP11531 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DmdP11531 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DmdP11531 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmdP11531 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmdP11531 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmdP11531 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmdP11531 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmdP11531 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmdP11531 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DmdP11531 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DmdP11531 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmdP11531 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmdP11531 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DmdP11531 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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