Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv4P11370 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fv4P11370 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fv4P11370 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fv4P11370 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv4P11370 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fv4P11370 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fv4P11370 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fv4P11370 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fv4P11370 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv4P11370 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv4P11370 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv4P11370 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv4P11370 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms