Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FlgP11088 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FlgP11088 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FlgP11088 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FlgP11088 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FlgP11088 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FlgP11088 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FlgP11088 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FlgP11088 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FlgP11088 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FlgP11088 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FlgP11088 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FlgP11088 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FlgP11088 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FlgP11088 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FlgP11088 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FlgP11088 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FlgP11088 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FlgP11088 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FlgP11088 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FlgP11088 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FlgP11088 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FlgP11088 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FlgP11088 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FlgP11088 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FlgP11088 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FlgP11088 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FlgP11088 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FlgP11088 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FlgP11088 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FlgP11088 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FlgP11088 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FlgP11088 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FlgP11088 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FlgP11088 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FlgP11088 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FlgP11088 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FlgP11088 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FlgP11088 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FlgP11088 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FlgP11088 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FlgP11088 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FlgP11088 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FlgP11088 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FlgP11088 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FlgP11088 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FlgP11088 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FlgP11088 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FlgP11088 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FlgP11088 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FlgP11088 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FlgP11088 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FlgP11088 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FlgP11088 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FlgP11088 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FlgP11088 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FlgP11088 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FlgP11088 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FlgP11088 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FlgP11088 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FlgP11088 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FlgP11088 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FlgP11088 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FlgP11088 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FlgP11088 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FlgP11088 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FlgP11088 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FlgP11088 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FlgP11088 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FlgP11088 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FlgP11088 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FlgP11088 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FlgP11088 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FlgP11088 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FlgP11088 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FlgP11088 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FlgP11088 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FlgP11088 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FlgP11088 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FlgP11088 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FlgP11088 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FlgP11088 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FlgP11088 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FlgP11088 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FlgP11088 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FlgP11088 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FlgP11088 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FlgP11088 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms