Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb3P09026 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb3P09026 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb3P09026 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms