Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa1P09022 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa1P09022 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa1P09022 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms