Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04212 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04212 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04212 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04212 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P04212 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04212 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P04212 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P04212 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P04212 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P04212 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P04212 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04212 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04212 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04212 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04212 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04212 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04212 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04212 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04212 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04212 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04212 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04212 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P04212 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04212 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04212 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04212 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04212 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04212 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04212 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04212 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04212 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04212 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04212 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04212 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04212 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04212 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04212 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04212 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04212 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04212 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04212 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04212 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04212 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04212 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04212 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04212 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04212 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04212 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04212 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04212 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04212 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04212 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P04212 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P04212 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04212 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P04212 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04212 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04212 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms