Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-LP01897 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-LP01897 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-LP01897 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-LP01897 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-LP01897 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-LP01897 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-LP01897 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-LP01897 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-LP01897 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-LP01897 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-LP01897 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-LP01897 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms