Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc6O89033 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc6O89033 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc6O89033 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc6O89033 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc6O89033 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms